MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER52552	chr1	27945939	27946074	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER139151	chr1	69675809	69677315	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER160302	chr1	82492479	82494151	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER172457	chr1	90233281	90234825	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER172459	chr1	90235127	90235252	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER179074	chr1	94463560	94463931	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER179075	chr1	94463948	94464902	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER203910	chr1	109164504	109166011	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER206864	chr1	111082994	111084541	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER322600	chr1	181986640	181987290	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER322602	chr1	181987506	181988458	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER323567	chr1	182628042	182629497	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER324133	chr1	182985088	182985396	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER324134	chr1	182985421	182985524	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER354918	chr1	201661020	201662570	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER411078	chr2	8243582	8243819	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER411091	chr2	8252588	8253849	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER412640	chr2	9247383	9249073	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER419946	chr2	14316570	14317855	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER444406	chr2	29994685	29996347	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER448918	chr2	33002899	33004472	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER462246	chr2	41716101	41717686	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER469413	chr2	45801823	45802919	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER508562	chr2	67725732	67725836	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER508568	chr2	67728495	67729487	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER508570	chr2	67729776	67730057	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER551325	chr2	91796916	91797354	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER551327	chr2	91797659	91797915	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER558262	chr2	95835059	95836347	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER576241	chr2	105715312	105715419	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER592657	chr2	116114359	116115886	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER595816	chr2	118058233	118058553	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER623392	chr2	136129834	136130113	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER623394	chr2	136130285	136130465	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER633889	chr2	142736740	142738308	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER672157	chr2	165929114	165930900	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER692515	chr2	177978951	177979390	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER692516	chr2	177979390	177979743	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER695055	chr2	179542731	179544296	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER721820	chr3	5846872	5847465	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER721823	chr3	5848859	5849262	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER934316	chr3	146955979	146956102	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER934317	chr3	146956110	146956189	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER934320	chr3	146956496	146957352	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER944095	chr3	153397778	153399335	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER948962	chr3	156510340	156511053	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER948963	chr3	156511051	156511315	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER949941	chr3	157166294	157166848	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER955517	chr3	160800665	160802221	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1063933	chr4	29924444	29924756	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1067987	chr4	32421136	32421609	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1068060	chr4	32466988	32468615	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1102311	chr4	51879057	51880726	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1107164	chr4	54873658	54875269	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1125470	chr4	66935496	66936997	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1125472	chr4	66937302	66937570	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1131223	chr4	70457293	70458366	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1184326	chr4	104552276	104552453	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1205405	chr4	117248467	117248629	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1266592	chr4	155937475	155938499	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1266594	chr4	155938801	155939346	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1297623	chr5	8626818	8628383	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1357058	chr5	43056780	43057949	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1440360	chr5	95432114	95433668	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1460122	chr5	108375892	108377517	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1474953	chr5	117942671	117944248	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1535562	chr5	156667048	156668637	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1544237	chr5	161971718	161971947	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1544240	chr5	161972878	161974027	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1544242	chr5	161974250	161974421	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1544244	chr5	161974515	161974724	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1584271	chr6	7869601	7871343	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1636737	chr6	40288354	40289895	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1636741	chr6	40291870	40291944	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1679663	chr6	68931895	68932121	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1679668	chr6	68939104	68940603	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1693574	chr6	77012434	77013029	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1702053	chr6	82558777	82560261	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1711675	chr6	89036898	89038473	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1742691	chr6	109810729	109812363	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1801117	chr6	145446528	145448220	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1827793	chr6	159401651	159402522	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1827795	chr6	159402825	159403561	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1863251	chr7	2739811	2740295	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1864223	chr7	3212802	3212924	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1864243	chr7	3223091	3223347	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1864438	chr7	3409494	3409609	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1864460	chr7	3420611	3420725	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1864513	chr7	3448501	3448616	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1864547	chr7	3467304	3467419	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1864740	chr7	3572529	3573637	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1864742	chr7	3573857	3574174	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1864798	chr7	3607807	3608955	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER1864802	chr7	3610045	3610187	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER2153744	chr8	5225964	5227591	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER2208765	chr8	38516690	38516909	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER2235697	chr8	59610071	59610368	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER2273571	chr8	83236449	83236665	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER2273575	chr8	83237000	83238265	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER2273577	chr8	83238577	83238800	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER2285588	chr8	91257377	91257578	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER2381503	chr8	146293721	146294902	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER2381505	chr8	146295214	146295624	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER2539387	chr9	95227224	95227430	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER2539389	chr9	95227727	95228350	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER2597963	chr9	130352446	130352900	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER2597964	chr9	130353640	130354482	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER2600424	chr9	132496824	132498370	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER2687264	chr10	41974687	41974823	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER2769600	chr10	87724401	87724653	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER2814843	chr11	20064928	20065252	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER2814845	chr11	20065543	20066960	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER2819808	chr11	23226271	23227941	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER2866610	chr11	51746504	51747800	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER2867050	chr11	52015797	52017372	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER2867847	chr11	52575140	52576319	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER2867850	chr11	52577235	52577433	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER2867852	chr11	52578410	52578610	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER2898951	chr11	70878064	70878397	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER2950906	chr11	100834132	100835471	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER3026062	chr12	4800935	4801137	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER3064815	chr12	31060923	31062564	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER3092579	chr12	48611452	48611573	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER3092583	chr12	48612329	48613412	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER3092585	chr12	48613734	48613907	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER3094263	chr12	49661880	49663594	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER3098212	chr12	52278670	52280028	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER3100851	chr12	53972464	53972660	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER3100853	chr12	53973239	53973446	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER3100855	chr12	53974160	53975351	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER3275608	chr13	53972725	53973496	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER3324896	chr13	83572693	83572987	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER3324898	chr13	83573287	83573309	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER3324900	chr13	83573459	83573483	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER3324902	chr13	83573643	83574009	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER3393506	chr13	132391670	132392121	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER3393508	chr13	132392417	132393344	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER3393509	chr13	132393338	132393503	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER3542176	chr14	86533785	86535322	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER3549776	chr14	91587778	91587880	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER3604067	chr14	123870335	123871178	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER3820414	chr16	6744594	6744873	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER3820416	chr16	6745175	6745778	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER3820418	chr16	6745808	6746450	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER3820420	chr16	6746748	6746973	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER3828279	chr16	10807753	10809343	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER3860614	chr16	29075421	29076439	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER3945388	chr16	73930902	73931456	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER4010362	chr17	35313906	35315470	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER4022911	chr17	44124550	44125324	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER4055360	chr17	65499214	65499450	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER4056210	chr17	66010050	66011669	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER4057073	chr17	66548984	66550415	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER4060921	chr17	69025031	69026665	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER4155044	chr18	36219069	36220758	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER4262732	chr19	35224770	35226319	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER4262809	chr19	35286615	35288185	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER4262994	chr19	35400340	35401042	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER4262997	chr19	35401381	35401455	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER4418321	chr20	61416207	61417477	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER4418322	chr20	61417463	61417569	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER4457672	chr20	82150839	82151180	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER4534970	chrX	38615142	38616683	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER4534972	chrX	38616993	38617176	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER4565779	chrX	56332275	56332384	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER4565782	chrX	56332808	56332851	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER4565784	chrX	56333842	56335241	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER4566552	chrX	62049019	62050344	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER4566949	chrX	62372397	62372441	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER4566951	chrX	62372824	62372999	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER4566953	chrX	62373619	62374745	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER4590914	chrX	77877130	77877209	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER4612648	chrX	92960261	92960580	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER4612650	chrX	92960947	92961657	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER4612651	chrX	92961716	92961853	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER4612652	chrX	92961858	92961969	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER4626304	chrX	101993337	101994625	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER4630165	chrX	104417682	104418511	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER4683628	chrX	136260076	136261589	0	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER4689793	chrX	140015217	140015332	1	LTR
MSTC-int|LTR|MaLR-HOMER4689795	chrX	140015635	140015919	1	LTR
